
Музей Новосибирска был задуман еще в 1943-ем году. Таким образом, планировалось отпраздновать пятидесятилетие города. Тогда исполнению проекта помешала война с фашистами. Открытие музея состоялось много позже – 1-го марта 2010-го года. Экспозиции было решено разместить в архитектурно-историческом памятнике «Дом Кондратюка Ю.В.», построенном в 1924-ом году. Основоположник отечественной космонавтики проживал здесь с 1927-го по 1930-ый годы. Изначально Дом был полностью мемориальным музеем имени Кондратюка. Со временем все помещения, кроме двух залов, занял музей города.
Сразу после открытия музей заявил о себе выставками о вкладе Новосибирска в победу над фашизмом, о городах-побратимах, о развитии астрономии в области, о людях и их образе жизни. С 2011-го года при заведении работает Центр устной истории, где собирается архив аудио-, видео-, фотоматериалов по формированию и развитию города.
На первом этаже залы оснащены мультимедийным оборудованием, что позволяет проводить конференции, семинары и встречи с сопровождением кинопоказов.